Высшим руководящим органом Торгово-промышленной палаты Республики Абхазия является Общее Собрание членов Палаты, проводимое не реже одного раза в год.
Общее Собрание избирает Правление и Президента Палаты, Ревизионную комиссию. Правление ТПП РА возглавляется Председателем Правления, которым по должности является Президент Палаты. В состав Правления входит по должности вице-президент Палаты.